متن پیام حضرت آیت‌الله خامنه‌ای به شرح زیر است:
بسم الله الرحمن الرحیم
درگذشت جناب حجة الاسلام والمسلمین آقای حاج سید علی ابطحی اصفهانی رحمةالله علیه را به بازماندگان محترم و به خاندان علمی موّحد ابطحی و به علاقمندان ایشان تسلیت عرض میکنم و رحمت و مغفرت الهی را برای ایشان مسألت مینمایم.
سید علی خامنه‌ای